雨隱村永遠籠罩在悲傷的雨絲之中，沒(méi)人知道大陸上囂張跋扈的強大叛忍組織‘曉’就藏身在這里。

曉組織剛組建的時(shí)候有三個(gè)忍者，正是自來(lái)也教導過(guò)兩年的彌彥，長(cháng)門(mén)和小南。彌彥從自來(lái)也身上學(xué)會(huì )了守護和平的理念，于是和兩個(gè)好伙伴成立曉，立志改變忍者世界，不再讓二戰這樣的悲劇發(fā)生。

二戰的主要戰場(chǎng)就是他們居住的雨之國，當初被稱(chēng)為忍界本來(lái)事情到這里還有余地，然而長(cháng)門(mén)這個(gè)本來(lái)就沒(méi)有目標的男人接過(guò)了彌彥的遺愿，成為了曉的領(lǐng)導，開(kāi)始將‘曉’變?yōu)榭植澜M織。

當然長(cháng)門(mén)也并不是一開(kāi)始就黑化的，在暗中還有一個(gè)人影響著(zhù)他，就是宇智波帶土。開(kāi)始宇智波帶土是按照宇智波斑的安排和曉組織接觸，因為長(cháng)門(mén)的輪回眼就是斑移植給他的。斑知道自己快死了，在和初代目一戰之中他也傷的不輕，所以他安排了復活事宜。只要使用輪回眼的秘術(shù)，就能讓人起死回生。

而這雙輪回眼正是宇智波斑一生中最高的成就，直到生命的盡頭才覺(jué)醒的終極武器。

斑一開(kāi)始就選擇長(cháng)門(mén)，后來(lái)更是希望把‘曉’變?yōu)橐粋€(gè)為了復活他而活動(dòng)的組織，當然作為報酬他將會(huì )為曉實(shí)現‘永恒的和平’。

彌彥活著(zhù)的時(shí)候表示十分感動(dòng)但拒絕了，他從自來(lái)也身上學(xué)到和平是需要自己雙手來(lái)爭取和守護的，并沒(méi)有捷徑。

然而彌彥死了，證明他堅持的理念錯了。如果還是希望和平的話(huà)，長(cháng)門(mén)必須要另辟蹊徑，于是他聽(tīng)從帶土的建議，終于走上了斑安排的道路。

此時(shí)小南站在雨中，腦海里抹不掉那些無(wú)辜孩童慘白的面龐，那些年輕的生命就這么逝去了，就好像被驟雨摧殘凋謝的花朵，被他們親手打落。

一直以來(lái)堅信自己能帶去和平，可是現在看‘和平’的代價(jià)或許是他們不能付出的。還有曉組織的那些叛忍，難道沒(méi)有一點(diǎn)人性么？看到這么多孩子死去竟然無(wú)動(dòng)于衷，小南動(dòng)搖了。

淅淅瀝瀝的雨中，帶土躲在暗中觀(guān)察。他能感到小南的心境變化，其實(shí)他也很震驚，不知道誰(shuí)會(huì )用這樣的手段。

不過(guò)帶土能確定，這種行為并不是要打敗曉，而是要從心理上瓦解曉的成員，其心可誅。這個(gè)大陸上能做到這個(gè)的恐怕并沒(méi)有幾個(gè)人，就算是擅長(cháng)幻術(shù)的宇智波家族也沒(méi)有人能做到，帶土的腦海里浮現出了一個(gè)許久不見(jiàn)的‘熟人’——杜蘭。

但沒(méi)有證據，而且現在幕后黑手已經(jīng)不重要了，重要的是必須要完成斑的計劃，到時(shí)候所有人都會(huì )得到幸福。

帶土也是有個(gè)故事的人，他也是被斑陷害才成為斑的繼承人的。

當然斑也有故事，他所做的一切也并非他自己一個(gè)人完成的，他有一個(gè)名為‘絕’的合作伙伴。